De auto-immuunziekten SLE, Sclerodermie en MCTD hebben algemene overlappende symptomen, zoals extreme vermoeidheid, gewrichts- en spierklachten en meestal een verhoogd ANA/ANF-factor. Naast deze ziekten kunnen ook het fenomeen van Raynaud, het Antifosfolipiden syndroom en het secundair Sjögren syndroom voorkomen. Door specifieke symptomen en verder onderzoek kan een diagnose gesteld worden.